O Sistema de Gerenciamento da Segurança Operacional difere do Sistema de Gestão da Qualidade essencialmente quanto ao foco. Enquanto o SGSO deve se concentrar nos aspectos humanos e organizacionais de um PSAC, com foco na satisfação da segurança operacional, o SGQ se concentra no(s) produto(s) ou serviços da organização, com foco na satisfação do cliente ou usuário final.

Entretanto, a Gestão da Segurança Operacional e a Gestão da Qualidade são complementares e podem trabalhar em conjunto para alcançar as metas de segurança operacional.

O componente “Garantia da Segurança Operacional” de um SGSO deve ser baseado em princípios de qualidade, provendo uma abordagem estruturada para fazer com que os processos e procedimentos de identificação de perigos e controle/mitigação dos riscos funcionem da forma prevista e, quando não se mostrarem eficazes, sejam revisados e melhorados.